对比新旧两版方案，新版方案在抗流感病毒推荐药物方面更加明确。抗流感病毒的西药，只推荐神经氨酸酶抑制剂，包括奥司他韦等。旧版方案中曾被推荐的金刚烷胺和金刚乙胺，新方案称该药仅对甲型流感病毒有效，但目前监测资料显示，甲型流感病毒对其耐药，不建议使用。在中药治疗方面，诊断方向主要是“风热犯卫”或“热毒袭肺”，成人推荐使用连花清瘟胶囊、银翘解毒类等中成药，过去的抗流感明星药物板蓝根不在推荐之列。国家卫计委这次发布的新方案还首次推荐了儿童抗流感的中成药，包括小儿肺热咳喘口服液等，并特别提醒，没有儿童适应症的中成药不宜给儿童使用。

新方案明确了流感的定义、症状、潜伏期等。流感患者和隐性感染者都是流感的主要传染源，受感染动物也可以成为传染源。流感通过打喷嚏和咳嗽等飞沫传播，也可经口腔、鼻腔、眼睛等黏膜直接或间接接触传播，接触被病毒污染的物品也可引起感染。病毒在人呼吸道分泌物中一般持续排毒3-6天，婴幼儿、免疫功能受损患者排毒时间可能超过1周。新方案明确抗流感病毒治疗时机，发病48小时内进行抗病毒治疗可减少流感并发症等，超过48小时的重症患者依然能从抗病毒治疗中获益。没有重症流感高危因素的患者，发病时间不足48小时，为缩短病程、减少并发症也可以抗病毒治疗。

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