2016年，中菲爆发南海仲裁争议，时任香港国际仲裁中心主席的郑若骅在研讨会上作总结发言，并就裁决进行深入分析。法律界形容她有魄力，有狠劲。郑若骅就“南海仲裁案”曾表示，根据《联合国海洋法公约》，争议双方应先进行友好协商，而菲律宾未有协商就提请仲裁；此外《公约》还涉及主权国家的保留，因此国际法庭对南海仲裁案并没有管辖权。

2016年7月，中国国际法学会和香港国际仲裁中心联合举办了“海洋争端解决国际法研讨会”上，针对临时仲裁庭对于“岛、礁”的定义，郑若骅在总结发言时指出，有参与制定《联合国海洋公约》的专家强调，临时仲裁庭擅自对“岛”的定义进行修改，提出“不靠外部资源维持人类生存”才称为“岛’。郑若骅表示，“按照如此定义，不能自己提供饮用水的香港和新加坡，是不是都是礁石呢？”

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