此外，香港航空还对航班处理程序进行探究，建立工作小组，密切关注航班的准点率情况，当有航班延误时，会立即分析原因并寻求解决方案，比如许多延误是由于等待转机乘客造成的，为解决问题，航线规划部会为一些连接航班延长留地时间以预留出更多的缓冲时间，一些航班的最少连接时间也进行了加长，比如所有以温哥华为出发地和目的地的连接航班的最少连接时间均由60分钟增加至90分钟。

但据央广新闻报道，为了提高航班准点率，航线的增长数量受到官方管控，林智杰认为，一方面航班的增量在减少，一方面又放开了价格，在这样的背景下，机票价格势必会上涨，“京广、京沪的价格会涨的高一点，因为本身这些航线总体就供不应求。”

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